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          漢坦病毒威脅?從極地疫情看真空草莓视频二维码如何護航NGS建庫

          發布時間:2026-05-13     瀏覽量:196

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          2026年4月至5月,一艘名為“洪迪厄斯”號(MV Hondius)的極地探險郵輪在大西洋航行期間,暴發了一場引發全球關注的漢坦病毒聚集性疫情。截至5月7日,世界衛生組織共報告8例病例,其中3例死亡,病死率高達37.5%。經南非國家傳染病研究所和瑞士日內瓦大學醫院確認,此次疫情的病原體為安第斯型漢坦病毒——這是目前已知唯一能夠發生有限人際傳播的漢坦病毒型別.


          當此類高致死率、可在密閉空間有限傳播的病毒疫情發生時,高通量測序(NGS) 是快速鑒定病毒亞型、追蹤變異和溯源傳播鏈條的核心技術。


          高通量測序(NGS)檢測步驟

          NGS 基本流程可簡化為 4 個核心步驟


          核酸提取與檢測:利用DNA和RNA在低鹽溶液中的溶解度差異,先沉澱分離DNA核蛋白,再去除蛋白雜質,即可獲得純化DNA。


          文庫建構與文庫檢測:DNA片段加接頭修飾的過程,包含末端修飾、添加接頭、PCR擴增、質量檢測等,完成建庫。


          上機測序:以Illumina測序平台為例,當單鏈化的文庫片段進入測序平台的流通池之後,可以與流通池表麵的寡核苷酸結合,從而進入測序過程。


          數據分析:對原始數據進行過濾、比對參考基因組、變異檢測等處理,最終解讀出生物意義(如基因突變、基因表達量等)


          如和確保建庫的順利完成?

          通常在利用雜交捕獲方法進行目的片段富集的測序中,需要在建庫完成後對樣品進行混合和濃縮。樣品為DNA 片段,大小200-400bp,濃縮過程要求將500-2000 ng DNA 文庫(20-100 uL)濃縮至無液體殘留,樣品之間無交叉汙染,同時要求樣品損失率低10%。


          真空草莓视频二维码濃縮方案

          利用真空草莓视频二维码可以在低溫(避免DNA斷裂)和真空環境下,溫和地去除樣本中的水分和有機溶劑的優勢,最終滿足上機要求。


          濃縮時間和損失率測試

          對不同體積樣品的濃縮時間和損失率進行測試,結果顯示平均損失率約為5%。在過度幹燥實驗中,回收率基本未受影響


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          表1 使用草莓视频APP下载IOS真空草莓视频二维码幹燥時間及回收率測試結果

          交叉汙染測試

          取DNA 樣品1(260bp,420bp,650bp 混合物)和DNA 樣品2(750 bp)各4份進行以下操作:

          (1)通過毛細電泳確認樣品中DNA 片段大小和分布情況;

          (2)樣品1 和2 同時進行濃縮,擺放位置分別選取相鄰和相對的空位;

          (3)完全幹燥後,加入50uL 水溶解,並重新進行毛細電泳檢測條帶

          分布情況。

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          表2 使用草莓视频APP下载IOS真空草莓视频二维码交叉汙染測試結果


          結果表明,真空草莓视频二维码憑借較高的向心力,可有效抑製樣品底部沸騰,避免交叉汙染。


          草莓视频APP下载IOSAuto R3一體式濃縮儀技術優勢:

          專為NGS 測序而設計,內置水、乙醇溶液專用程序,濃縮速度提升20%

          一體式,內置進口品牌隔膜泵

          一次最高可濃縮180支1.5ml EP管,且無交叉感染。

          兩段溫度控製設計,優化濃縮方案

          離心腔特氟龍塗層處理,整機防腐耐用

          操作簡單,一鍵運行

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